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十大正规网堵平台的研究人员帮助确定一种重要的人类RNA的三维结构

这是十大正规网堵平台一名研究生的合作成果, 两个高度专业化的十大正规网堵平台研究实验室和维也纳大学已经确定了一种参与癌症抑制和基因调控的特定长非编码RNA分子的三维结构.

他们的研究由研究生Michael D’souza领导,最近发表在 核酸的研究 并建立了一个识别分子整体结构的框架——这是建立抑制癌症和可能治疗的知识基础的关键砖.

了解RNA的功能首先要确定它的分子结构. 莱斯布里奇医学生物物理实验室的研究人员最近发现了长链非编码RNA,即长基因间非编码RNA-p21 (LincRNA-p21).

Dr. 医学生物物理实验室的Trushar Patel和他的团队帮助将RNA分子形象化.

RNA是一种多面分子,存在于所有活细胞中,具有多种功能, 包括编码和表达成功能蛋白的基因. 超过98%的人类基因组也转录参与调节基因表达的非编码RNA, 尤其是与癌症抑制和其他疾病相关的基因.

这些非编码rna的结构通常是未知的,研究人员也不知道这些rna是如何在三维空间中折叠的,也不知道它们如何与蛋白质进行交流以执行必要的功能.

该团队与十大正规网堵平台的博士合作,应用了分析式超离心技术. Borries Demeler和光散射法,以确保LincRNA-p21的纯度. 利用x射线散射技术. 化学系教授Trushar Patel说 & 生物化学和加拿大研究主席, 和他的团队已经确定了LincRNA-p21部分的整体三维结构. 与博士合作. 维也纳大学的Michael Wolfinger说, 该团队还帮助制作了高分辨率模型,展示了这些非编码rna如何在人体中折叠.

“可靠的网堵平台检测的非编码RNA与在癌细胞中观察到的定期突变的基因有关,” says Patel. “通过确定它们的整体结构, 以及特定结构元素如何影响细胞目标并与之相互作用, 研究人员正在努力建立一个关于癌症抑制和可能治疗的知识基础.”

由于技术的限制以及人类非编码rna的灵活性和脆弱性, 研究人员开发了一种多管齐下的方法,使用了不同的技术, 比如生物物理和计算方法, 来帮助确定三维结构.

“可靠的网堵平台的工作为一种综合方法提供了一个框架,可以用于简化其他人类rna的结构确定,” says Patel.