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研究人员获得RDAR支持,以寻找减轻牛呼吸道疾病的可行解决方案

十大正规网堵平台南阿尔伯塔基因组科学中心(SAGSC)及其生物信息学核心的研究人员正在与加拿大农业和农业食品部(AAFC)的科学家合作,寻找缓解牛呼吸疾病(BRD)的可行解决方案,这是北美最突出的饲养场牛疾病,估计每年造成30亿加元的财政负担.

据估计,BRD每年要承担30亿美元的财政负担.

该项目由剑桥大学副教授(Dr. Athan Zovoilis and Dr. 蒂姆·麦卡利斯特是AAFC的首席研究科学家. Zovoilis博士,SAGSC主任和加拿大RNA生物信息学和基因组学研究主席. Angeliki Pantazi (SAGSC科学官员)和博士. Eric Merzetti (BioNet项目经理)正在与McAllister的团队和AAFC的其他科学家合作,推进基于基因组的BRD诊断管道, 基于艾伯塔省特有的病原体, 这将提高省级养牛业抗菌素使用的精确度.

“To date, 对于艾伯塔省的牛生产者来说,目前还没有用于广泛鉴定BRD病原体的工具,因此需要建立全省范围的体系结构来检测和描述BRD中感兴趣的病原体——包括毒力和抗微生物药物耐药性,” says Zovoilis. “可靠的网堵平台在SAGSC和莱斯布里奇AAFC的实验室已经测序了, analyzed, 并鉴定出大量的BRD细菌分离株.”

艾伯塔省有超过18000名养牛者.5 million cattle, making up 40.加拿大鹿群的4%(估计2020年7月). 艾伯塔省是加拿大养牛最多的省份,经济严重依赖出口牛肉, 牛的死亡率给该省造成了严重的经济和财政困难. BRD占饲养场总发病率的65- 80%和死亡率的45- 75%.

BRD病原体多种多样,可能起源于多个细菌科. BRD的正确治疗需要病原体鉴定. 进一步增加了治疗的难度, 抗微生物药物耐药性(AMR)在这些牛中引起了重大关注,许多已确定的BRD病原体对牲畜环境中使用的传统抗微生物药物具有耐药性.

“可靠的网堵平台将从可靠的网堵平台下一代测序平台测序的样本中获取输入数据,并能够产生关于BRD病原体的详细信息, including relevant AMR,” says Zovoilis. “这些数据将允许精确使用抗菌剂, 为牛提供了更好的结果,并降低了目前细菌产生AMR的可能性.”

The project, 阿尔伯塔肉牛呼吸道疾病病原体的综合测序和生物信息学分析管道该项目由35.2万美元的结果驱动农业研究(RDAR)资助. RDAR and Genome Alberta, 加拿大政府和阿尔伯塔农业公司, 林业与农村经济发展, announced $5.本月早些时候,加拿大农业伙伴关系(CAP)为农业基因组学项目提供了100万美元的资金.

“基因组学研究在现实世界中有实际应用,有助于在加拿大建立一个更可持续的农业部门,” says Marie-Claude Bibeau, 加拿大农业和农业食品部部长. “From developing new tools, 提高可靠的网堵平台所吃食物的质量, 培育更有弹性的作物-可靠的网堵平台的基因组研究人员是推进科学和创新的核心,这样可靠的网堵平台艾伯塔省的农民就有了成功所需的工具.”