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研究人员获得了RDAR的支持,以找到可行的解决方案来减轻牛呼吸道疾病

十大正规网堵平台南阿尔伯塔基因组科学中心(SAGSC)及其生物信息学核心的研究人员正在与加拿大农业和农业食品部(AAFC)的科学家合作,寻找减轻牛呼吸道疾病(BRD)的可行解决方案。BRD是北美饲养场最显著的牛疾病,估计每年造成30亿美元的经济负担.

据估计,复兴开发银行每年承担30亿美元的财政负担.

该项目由十大正规网堵平台副教授Dr. Athan Zovoilis and Dr. AAFC的首席研究科学家蒂姆·麦卡利斯特说. Zovoilis博士是加拿大RNA生物信息学和基因组学研究主席. Angeliki Pantazi (SAGSC科学官员)和Dr. 埃里克·默泽蒂(BioNet项目经理)正在与麦卡利斯特的团队和AAFC的其他科学家合作,推进BRD的基因组学诊断管道, 基于阿尔伯塔群体特异性病原体, 这将提高省养牛业抗菌药物使用的准确性.

“To date, 目前还没有针对艾伯塔省养牛者的大规模识别BRD病原体的工具,而且需要建立全省范围内的体系来检测和表征与BRD有关的病原体——包括毒性和抗菌素耐药性,” says Zovoilis. “可靠的网堵平台在SAGSC和位于莱斯布里奇的AAFC的实验室已经完成了测序, analyzed, 并对大量BRD细菌分离物进行了鉴定.”

阿尔伯塔省有18,000多名养牛者,估计有4名.5 million cattle, making up 40.加拿大牧群的4%(估计2020年7月). 艾伯塔省拥有全国最多的牛,经济严重依赖牛肉出口, 牲畜死亡给该省造成重大的经济和财政困难. BRD导致了整个饲养场发病率的65% - 80%和死亡率的45% - 75%.

BRD病原菌种类繁多,可能来自多个细菌家族. 正确处理BRD需要病原鉴定. 进一步增加了治疗的难度, 抗微生物药物耐药性(AMR)是这些牛的重大问题,许多已确定的BRD病原体对牲畜环境中使用的传统抗微生物药物具有耐药性.

“可靠的网堵平台将从下一代测序平台测序的样本中获取输入数据,从而能够生成BRD病原体的详细信息, including relevant AMR,” says Zovoilis. “这些数据将允许精确使用抗菌药物, 为牛提供了更好的结果,并降低了现有细菌中耐药性发展的可能性.”

The project, 艾伯塔省肉牛呼吸道疾病病原体的全面测序和生物信息学分析管道,得到了35.2万美元的结果驱动农业研究(RDAR)基金的支持. RDAR and Genome Alberta, 与加拿大政府和阿尔伯塔农业合作, “林业与农村经济发展”, announced $5.本月早些时候,加拿大农业伙伴关系(CAP)为农业基因组项目提供了100万美元的资金.

“基因组学研究具有实际的现实应用,有助于在加拿大建立一个更可持续的农业部门,” says Marie-Claude Bibeau, 加拿大农业和农业粮食部长. “From developing new tools, 提高可靠的网堵平台所吃食物的质量, 培育更有韧性的作物——可靠的网堵平台的基因组研究人员是推进科学和创新的核心,从而使可靠的网堵平台艾伯塔省的农民获得成功所需的工具.”